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B2M

基本情報

遺伝子名
beta-2-microglobulin
慣用名
IMD43
遺伝子分類
がん抑制遺伝子
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
免疫
シグナル伝達経路
Immune
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
15q21.1 (chr15:45003745..45008540)
アミノ酸配列の長さ
119

遺伝子マップ

解説

B2Mは、ほぼすべての有核細胞の表面にある主要組織適合遺伝子複合体(MHC)クラスI重鎖に関連して発見された血清タンパク質をコードする。この遺伝子は、大部分がβプリーツシート構造であり、いくつかの病状でアミロイド原線維を形成する。この遺伝子のバリアントは、異化亢進による低タンパク血症と関連している。

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌

ドライバー変異リスト

参照配列上の
位置
(GRCh37/hg19)
参照配列の塩基 変異の塩基 変異が位置するエクソン番号 変異
(アミノ酸
変化)
変異
(CDS
変化)
COSMIC登録ID (v92) がん化との
関連度による
分類
変異が検出されたサンプル数
chr15:45003745 A G 1 / 4 p.M1? c.1A>G COSV62562870 Tier2 4 / 92
chr15:45003745 A T 1 / 4 p.M1? c.1A>T COSV62562840 Tier2 2 / 92
chr15:45003746 T C 1 / 4 p.M1? c.2T>C COSV62563174 Tier2 2 / 92
chr15:45003750 TCG T 1 / 4 p.R3fs c.8_9delGC   Tier2 1 / 92
chr15:45003780 ACT A 1 / 4 p.L15fs c.43_44delCT COSV62562847 Tier2 32 / 92
chr15:45003780 A ACT 1 / 4 p.S16fs c.43_44dupCT   Tier2 1 / 92
chr15:45003785 CTCTT C 1 / 4 p.S16fs c.45_48delTTCT COSV62562863|COSV62562993 Tier2 9 / 92
chr15:45007665 G T 2 / 4 p.G38* c.112G>T   Tier2 1 / 92
chr15:45007672 C A 2 / 4 p.S40* c.119C>A   Tier2 2 / 92
chr15:45007688 CTA C 2 / 4 p.Y46fs c.137_138delAT COSV62563472 Tier2 2 / 92
chr15:45007688 C A 2 / 4 p.C45* c.135C>A COSV62563284 Tier2 1 / 92
chr15:45007719 G T 2 / 4 p.E56* c.166G>T COSV62563605 Tier2 1 / 92
chr15:45007729 T G 2 / 4 p.L59* c.176T>G   Tier2 1 / 92
chr15:45007740 G T 2 / 4 p.G63* c.187G>T COSV62564125 Tier2 1 / 92
chr15:45007740 GGA G 2 / 4 p.R65fs c.194_195delGA COSV62563423 Tier2 1 / 92
chr15:45007747 GA G 2 / 4 p.I66fs c.196delA   Tier2 1 / 92
chr15:45007752 G T 2 / 4 p.E67* c.199G>T COSV62564724 Tier2 1 / 92
chr15:45007793 G A 2 / 4 p.W80* c.240G>A   Tier2 1 / 92
chr15:45007799 CTA C 2 / 4 p.Y83fs c.248_249delAT COSV62563005 Tier2 1 / 92
chr15:45007801 ATC A 2 / 4 p.L85fs c.252_253delCT COSV62567214 Tier2 1 / 92
chr15:45007818 G T 2 / 4 p.E89* c.265G>T COSV62563917 Tier2 1 / 92
chr15:45007883 CAA C 2 / 4 p.K111fs c.331_332delAA   Tier2 1 / 92
chr15:45008529 C T 3 / 4 p.R117* c.349C>T COSV62562883 Tier2 1 / 92