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BRIP1
基本情報
- 遺伝子名
-
BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1
- 慣用名
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BACH1, FANCJ, OF
- 遺伝子分類
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がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
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ゲノム安定性の維持
- シグナル伝達経路
-
Core DNA Damage Response
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
17q23.2 (chr17:59760657..59938900, complement)
- アミノ酸配列の長さ
-
1,249
遺伝子マップ

解説
BRIP1 (FANCJ)はDNAヘリカーゼであり、BRCA1と相互作用をすることで、相同組み換え修復に関与する。生殖細胞系列変異は、家族性乳癌、卵巣癌および前立腺癌、そしてファンコニ貧血との関連性が知られている。
シグナル伝達経路
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布

- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
chr17:59934489 | TC | T | 4 / 20 | p.G103fs | c.308delG | Tier2 | 1 / 76 | |
chr17:59760875 | C | A | 20 / 20 | p.E1178* | c.3532G>T | Tier2 | 1 / 76 |