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GATA6

基本情報

遺伝子名
GATA binding protein 6
遺伝子分類
-
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
転写制御
シグナル伝達経路
Transcriptional regulation
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
18q11.2 (chr18:19751106..19780786)
アミノ酸配列の長さ
595

遺伝子マップ

解説

GATA6は真核生物の発生に関与するGATAファミリーに属する転写制御因子である。GATAファミリーにはGATA1からGATA6があり、GATA1, GATA2およびGATA3については造血幹細胞の、GATA4, GATA5およびGATA6は、内胚葉および中胚葉組織の発達と分化に関与する。GATA6のがんとの関係については、がん抑制遺伝子としての報告がある一方で、膵臓および胆道癌では、遺伝子増幅とそれに伴う発現量の増加が認められ、それが細胞増殖の亢進に関与していることが報告されており、がん種によってはがん遺伝子として機能する可能性が示唆されている。また、大腸癌におけるGATA6過剰発現は、予後不良因子として報告されている。

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌