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IDH2
基本情報
- 遺伝子名
-
isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2
- 慣用名
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D2HGA2, ICD-M, IDHM, IDPM, mNADP-IDH
- 遺伝子分類
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がん遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
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エピジェネティック制御
- シグナル伝達経路
-
Epigenetic modification
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
15q26.1 (chr15:90627498..90645622, complement)
- アミノ酸配列の長さ
-
452
遺伝子マップ

解説
IDH2は、TCAサイクルにおいてイソクエン酸からαケトグルタル酸への転換を触媒するイソクエン酸デヒドロゲナーゼであり、ミトコンドリアに局在する。体細胞変異は、急性骨髄性白血病および神経膠腫において認められ、172番目もしくは140番目のアルギニン残基がホットスポットである。これらの変異は機能獲得型変異であり、αケトグルタル酸から新たな2-ヒドロキシグルタル 酸(2-HG)の産生を可能にする。オンコメタボライトと言われるこの2HGの異常蓄積は、αケトグルタル酸を基質として必要とするDNA脱メチル化に関与するTET、ヒストン脱メチル化に関与するKDM4Cの活性を阻害することでエピジェネティクス異常を引き起こし、がん化を誘導する。
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布

- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
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chr15:90631838 | C | T | 4 / 11 | p.R172K | c.515G>A | COSV57468734 | Tier1 | 1 / 37 |
chr15:90631839 | T | A | 4 / 11 | p.R172W | c.514A>T | COSV57468942 | Tier2 | 1 / 37 |
chr15:90631934 | C | T | 4 / 11 | p.R140Q | c.419G>A | COSV57468751 | Tier1 | 1 / 37 |