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IDH2

基本情報

遺伝子名
isocitrate dehydrogenase (NADP(+)) 2
慣用名
D2HGA2, ICD-M, IDHM, IDPM, mNADP-IDH
遺伝子分類
がん遺伝子
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
エピジェネティック制御
シグナル伝達経路
Epigenetic modification
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
15q26.1 (chr15:90627498..90645622, complement)
アミノ酸配列の長さ
452

遺伝子マップ

解説

IDH2は、TCAサイクルにおいてイソクエン酸からαケトグルタル酸への転換を触媒するイソクエン酸デヒドロゲナーゼであり、ミトコンドリアに局在する。体細胞変異は、急性骨髄性白血病および神経膠腫において認められ、172番目もしくは140番目のアルギニン残基がホットスポットである。これらの変異は機能獲得型変異であり、αケトグルタル酸から新たな2-ヒドロキシグルタル 酸(2-HG)の産生を可能にする。オンコメタボライトと言われるこの2HGの異常蓄積は、αケトグルタル酸を基質として必要とするDNA脱メチル化に関与するTET、ヒストン脱メチル化に関与するKDM4Cの活性を阻害することでエピジェネティクス異常を引き起こし、がん化を誘導する。

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌

ドライバー変異リスト

参照配列上の
位置
(GRCh37/hg19)
参照配列の塩基 変異の塩基 変異が位置するエクソン番号 変異
(アミノ酸
変化)
変異
(CDS
変化)
COSMIC登録ID (v92) がん化との
関連度による
分類
変異が検出されたサンプル数
chr15:90631838 C T 4 / 11 p.R172K c.515G>A COSV57468734 Tier1 1 / 37
chr15:90631839 T A 4 / 11 p.R172W c.514A>T COSV57468942 Tier2 1 / 37
chr15:90631934 C T 4 / 11 p.R140Q c.419G>A COSV57468751 Tier1 1 / 37