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PTPRO

基本情報

遺伝子名
protein tyrosine phosphatase receptor type O
慣用名
GLEPP1, NPHS6, PTP-OC, PTP-U2, PTPROT, PTPU2, R-PTP-O
遺伝子分類
-
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
腫瘍形成・増殖
シグナル伝達経路
RTK
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
12p12.3, 12p13-p12 (chr12:15475661..15747975)
アミノ酸配列の長さ
1,216

遺伝子マップ

解説

PTPROは、受容体型タンパク質チロシンフォスファターゼのR3サブタイプファミリーで、極性細胞の頂端面に局在し、Srcファミリーキナーゼの活性化を介して組織特異的に機能する。この遺伝子は、2つの異なるプロモーターを含み、複数のアイソフォームをコードする選択的にスプライズされた転写物バリアントを生じる。また、破骨細胞の産生および活性の調節、細胞増殖の阻害ならびにアポトーシスを促進する。この遺伝子は、腫瘍抑制因子の候補でいくつかのがんにおいて、その発現低下が観察されている。

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌