SKP2は、約40アミノ酸のモチーフであるFボックスが特徴のFボックスタンパク質ファミリーで、SCF（SKP1-カリン-Fボックス）と呼ばれるユビキチンタンパク質リガーゼ複合体の4つのサブユニットのうち1つを構成し、リン酸化依存性ユビキチン化において機能する。Fボックスタンパク質は、WD-40ドメインを有するFbw、ロイシンリッチリピートを有するFblおよび異なるタンパク質-タンパク質相互作用モジュールを有する/あるいは認識可能なモチーフを有さないFbx、の3つのクラスに分けられる。この遺伝子は、Fblクラスに属し、Fボックスに加え、10個のタンデムロイシンリッチリピートを有する。また、サイクリンA-CDK2 S期キナーゼの必須要素である。これは主にS期においてリン酸化されたサイクリン依存性キナーゼ阻害剤1B（CDKN1B、p27またはKIP1とも呼ばれる）を特異的に認識し、S期キナーゼ関連タンパク質1（SKP1またはp19）と相互作用する。さらに、この遺伝子は、リンパ腫の原因として関与するがん原遺伝子である。