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TSC1

基本情報

遺伝子名
TSC complex subunit 1
慣用名
TSC
遺伝子分類
がん抑制遺伝子
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
腫瘍形成・増殖
シグナル伝達経路
PI3K/Akt/mTOR
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
9q34.13 (chr9:135771622..135804259, complement)
アミノ酸配列の長さ
1,164

遺伝子マップ

解説

TSC1は、mTOR I型複合体 (mTORC1)の活性調節に働くがん抑制遺伝子である。mTORC1の活性化にはGTP結合型のRhebが必要である。TSC1はTSC2とヘテロ二量体を形成し、そのGTPase-activating protein(GAP)活性により、RHEBを不活性型のGDP結合型にすることで、mTORC1の活性を抑制する。上流のPI3Kの活性化は、AktによるTSC2のリン酸化引き起こすことで、GAP活性を阻害する。その結果GTP結合型のRhebが増え、mTORC1の活性化につながる。TSC1の生殖細胞系列変異は結節性硬化症との関連が知られている。体細胞変異は、様々ながん種で見られ、その大部分が機能喪失型変異である。

シグナル伝達経路

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌

ドライバー変異リスト

参照配列上の
位置
(GRCh37/hg19)
参照配列の塩基 変異の塩基 変異が位置するエクソン番号 変異
(アミノ酸
変化)
変異
(CDS
変化)
COSMIC登録ID (v92) がん化との
関連度による
分類
変異が検出されたサンプル数
chr9:135801039 G A 5 / 23 p.Q100* c.298C>T   Tier2 1 / 95
chr9:135801105 C A 5 / 23 p.E78* c.232G>T COSV53765645 Tier2 1 / 95
chr9:135798859 GACA G 6 / 23 p.V128del c.381_383delTGT COSV53767756 Tier2 1 / 95
chr9:135797330 A G 7 / 23 p.L180P c.539T>C   Tier2 1 / 95
chr9:135796805 G A 8 / 23 p.R228* c.682C>T COSV53767064 Tier2 2 / 95
chr9:135782182 ATCACTTAGAGTGAC A 14 / 23 p.V454fs c.1360_1373delGTCACTCTAAGTGA   Tier2 1 / 95
chr9:135781248 G A 15 / 23 p.Q573* c.1717C>T   Tier2 1 / 95
chr9:135781386 G A 15 / 23 p.Q527* c.1579C>T COSV53763886 Tier2 1 / 95
chr9:135781440 G A 15 / 23 p.R509* c.1525C>T COSV53764587 Tier2 1 / 95
chr9:135781448 GGA G 15 / 23 p.P506fs c.1515_1516delTC   Tier2 1 / 95
chr9:135778009 G A 18 / 23 p.Q792* c.2374C>T   Tier2 1 / 95
chr9:135772964 C A 21 / 23 p.E887* c.2659G>T   Tier2 1 / 95
chr9:135772018 T TC 23 / 23 p.G1034fs c.3098dupG   Tier2 1 / 95