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ATR
基本情報
- 遺伝子名
-
ATR serine/threonine kinase
- 慣用名
-
FCTCS, FRP1, MEC1, SCKL, SCKL1
- 遺伝子分類
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がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
-
ゲノム安定性の維持
- シグナル伝達経路
-
TP53
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
3q23 (chr3:142168271..142297546, complement)
- アミノ酸配列の長さ
-
2,644
遺伝子マップ
解説
ATRは、セリン/スレオニンキナーゼであり、DNA損傷応答に関与するがん抑制遺伝子である。紫外線などによるDNAの障害および複製の停滞などの異常が発生した場合に活性化され、下流のCHK1キナーゼを活性化する。CHK1が制御する分子の中にはCDK1の活性化に関与する脱リン酸化酵素CDC25Cがある。CHK1の活性化によりCDC25Cはリン酸化され核外への移行が進むため、CDK1の活性化に必要な脱リン酸化が進まず、M期への進行が阻害されG2期停止が起きる。また、ATRおよびCHK1は共にTP53の活性化に関与し、DNAの修復反応、細胞周期の停止およびアポトーシスの誘導を引き起こす。生殖細胞系列変異は、Seckel 症候群との関連性が知られている。体細胞変異の頻度は高くないものの結腸癌、胃癌、食道癌など、様々ながん種において認められる。前臨床での検討において、ATRの機能喪失はPARP阻害剤への感受性を示すと共に、化学療法への感受性の増加との関連が報告されている。
シグナル伝達経路
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
chr3:142284984 | C | A | 3 / 47 | p.E91* | c.271G>T | COSV63383734 | Tier2 | 1 / 125 |
chr3:142281802 | C | A | 4 / 47 | p.E148* | c.442G>T | COSV63385454 | Tier2 | 1 / 125 |
chr3:142280188 | G | A | 5 / 47 | p.Q416* | c.1246C>T | Tier2 | 1 / 125 | |
chr3:142278223 | C | T | 7 / 47 | p.W534* | c.1602G>A | Tier2 | 1 / 125 | |
chr3:142275264 | TGCAATAAGATAAAAAATCCA | T | 9 / 47 | p.S673fs | c.2019_2038delTGGATTTTTTATCTTATTGC | Tier2 | 2 / 125 | |
chr3:142269045 | C | A | 14 / 47 | p.E969* | c.2905G>T | COSV63386308 | Tier2 | 1 / 125 |
chr3:142266741 | TTC | T | 16 / 47 | p.E1061fs | c.3181_3182delGA | Tier2 | 1 / 125 | |
chr3:142226775 | G | A | 28 / 47 | p.Q1677* | c.5029C>T | Tier2 | 1 / 125 | |
chr3:142226829 | C | A | 28 / 47 | p.E1659* | c.4975G>T | COSV63388634 | Tier2 | 1 / 125 |
chr3:142224067 | C | A | 29 / 47 | p.E1704* | c.5110G>T | Tier2 | 1 / 125 | |
chr3:142212062 | A | C | 35 / 47 | p.L1997* | c.5990T>G | Tier2 | 1 / 125 | |
chr3:142188982 | G | A | 37 / 47 | p.R2089* | c.6265C>T | Tier2 | 1 / 125 | |
chr3:142168414 | G | A | 47 / 47 | p.R2598* | c.7792C>T | COSV53817531 | Tier2 | 1 / 125 |