Side Menu

ATR

基本情報

遺伝子名
ATR serine/threonine kinase
慣用名
FCTCS, FRP1, MEC1, SCKL, SCKL1
遺伝子分類
がん抑制遺伝子
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
ゲノム安定性の維持
シグナル伝達経路
TP53
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
3q23 (chr3:142168271..142297546, complement)
アミノ酸配列の長さ
2,644

遺伝子マップ

解説

ATRは、セリン/スレオニンキナーゼであり、DNA損傷応答に関与するがん抑制遺伝子である。紫外線などによるDNAの障害および複製の停滞などの異常が発生した場合に活性化され、下流のCHK1キナーゼを活性化する。CHK1が制御する分子の中にはCDK1の活性化に関与する脱リン酸化酵素CDC25Cがある。CHK1の活性化によりCDC25Cはリン酸化され核外への移行が進むため、CDK1の活性化に必要な脱リン酸化が進まず、M期への進行が阻害されG2期停止が起きる。また、ATRおよびCHK1は共にTP53の活性化に関与し、DNAの修復反応、細胞周期の停止およびアポトーシスの誘導を引き起こす。生殖細胞系列変異は、Seckel 症候群との関連性が知られている。体細胞変異の頻度は高くないものの結腸癌、胃癌、食道癌など、様々ながん種において認められる。前臨床での検討において、ATRの機能喪失はPARP阻害剤への感受性を示すと共に、化学療法への感受性の増加との関連が報告されている。

シグナル伝達経路

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌

ドライバー変異リスト

参照配列上の
位置
(GRCh37/hg19)
参照配列の塩基 変異の塩基 変異が位置するエクソン番号 変異
(アミノ酸
変化)
変異
(CDS
変化)
COSMIC登録ID (v92) がん化との
関連度による
分類
変異が検出されたサンプル数
chr3:142284984 C A 3 / 47 p.E91* c.271G>T COSV63383734 Tier2 1 / 125
chr3:142281802 C A 4 / 47 p.E148* c.442G>T COSV63385454 Tier2 1 / 125
chr3:142280188 G A 5 / 47 p.Q416* c.1246C>T   Tier2 1 / 125
chr3:142278223 C T 7 / 47 p.W534* c.1602G>A   Tier2 1 / 125
chr3:142275264 TGCAATAAGATAAAAAATCCA T 9 / 47 p.S673fs c.2019_2038delTGGATTTTTTATCTTATTGC   Tier2 2 / 125
chr3:142269045 C A 14 / 47 p.E969* c.2905G>T COSV63386308 Tier2 1 / 125
chr3:142266741 TTC T 16 / 47 p.E1061fs c.3181_3182delGA   Tier2 1 / 125
chr3:142226775 G A 28 / 47 p.Q1677* c.5029C>T   Tier2 1 / 125
chr3:142226829 C A 28 / 47 p.E1659* c.4975G>T COSV63388634 Tier2 1 / 125
chr3:142224067 C A 29 / 47 p.E1704* c.5110G>T   Tier2 1 / 125
chr3:142212062 A C 35 / 47 p.L1997* c.5990T>G   Tier2 1 / 125
chr3:142188982 G A 37 / 47 p.R2089* c.6265C>T   Tier2 1 / 125
chr3:142168414 G A 47 / 47 p.R2598* c.7792C>T COSV53817531 Tier2 1 / 125