BRCA2は相同組み換えによるDNA二本鎖切断の修復過程に関与する。DNA切断部位では、MRN複合体 [MRE11/ RAD50/NBS1(NBN)]、BRCA1、そしてCtIPによる複合体が形成される。続いて、その形成された複合体の5’→3’エキソヌクレアーゼ活性により一本鎖3’末端が作られ、そこにRPA (Replication protein A) が結合することによって安定化される。BRCA2はそのRPAとRAD51の交換反応を促進し、繊維状のRAD51重合体の形成に働く。その後、RAD51重合体が姉妹染色分体の相同配列部位に侵入し、一本鎖の交換反応を行うことでホリデイジャンクションが形成され修復反応が完了する。BRCA2の生殖細胞系列バリアントは常染色体優性遺伝の疾患である遺伝性乳癌・卵巣癌症候群 (Hereditary Breast and Ovarian Cancer syndrome: HBOC) や家族性膵癌 (Familial Pancreatic Carcinoma: FPC)と関連することが知られている。