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CDKN2A

基本情報

遺伝子名
cyclin dependent kinase inhibitor 2A
慣用名
ARF, CDKN2, CMM2, INK4, INK4A, MLM, MTS-1, MTS1, P14, P14ARF, P16, P16-INK4A, P16INK4, P16INK4A, P19, P19ARF, TP16
遺伝子分類
がん抑制遺伝子
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
細胞周期
シグナル伝達経路
Cell cycle
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
9p21.3 (chr9:21968228..21974826, complement)
アミノ酸配列の長さ
156

遺伝子マップ

解説

CDKN2Aの座位には2種類のタンパクp16INK4Aおよびp14ARFがコードされている。p16INK4Aはサイクリン依存性キナーゼ (CDK)阻害分子であり、CDK4/6のサイクリンDへの結合を阻害する。そのため、サイクリンD-CDK4/6複合体によるRBのリン酸化が抑制され、RBによる転写制御因子E2Fの阻害が引き起こされる。その結果、E2Fの制御下にあるG1期からS期への移行に関与する遺伝子群の発現が抑制され細胞周期の進行が停滞する。一方で、p14ARFはMDM2によるTP53の分解を阻害することで、TP53の細胞周期の停止機構やアポトーシスの誘導を促進かつ維持する働きを有する。上記の通り、CDKN2Aの座位より作られるp16INK4Aおよびp14ARFは共にがん抑制遺伝子としての機能を有している。腫瘍における遺伝子変化はがん種横断的に検出されており、欠失や短縮型の遺伝子変化がその大部分を占める。生殖細胞系列における遺伝子変化は、常染色体優性遺伝の疾患である膵臓がん・悪性黒色腫症候群 (家族性異型多発母斑黒色腫症候群, FAMMMPC)や家族性膵癌 (FPC)と関連することが知られている。CDKN2Aは同じくCDK4/6の抑制に働くCDK阻害分子であるCDKN2B (p15INK5B)と近接して存在する。

シグナル伝達経路

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌

ドライバー変異リスト

参照配列上の
位置
(GRCh37/hg19)
参照配列の塩基 変異の塩基 変異が位置するエクソン番号 変異
(アミノ酸
変化)
変異
(CDS
変化)
COSMIC登録ID (v92) がん化との
関連度による
分類
変異が検出されたサンプル数
chr9:21974677 C A 1 / 3 p.Q50H c.150G>T COSV58692109 Tier2 1 / 159
chr9:21974679 G A 1 / 3 p.Q50* c.148C>T COSV58683786 Tier1 1 / 159
chr9:21974684 G A 1 / 3 p.P48L c.143C>T COSV58683273 Tier1 2 / 159
chr9:21974695 G C 1 / 3 p.Y44* c.132C>G COSV58696346 Tier2 2 / 159
chr9:21974730 C A 1 / 3 p.E33* c.97G>T COSV58682729 Tier2 2 / 159
chr9:21974732 A G 1 / 3 p.L32P c.95T>C COSV58685103 Tier1 1 / 159
chr9:21974735 AGCGCCCGCACCTCCTCTACCCGACCCCGGGCC A 1 / 3 p.R22fs c.60_91delGGCCCGGGGTCGGGTAGAGGAGGTGCGGGCGC   Tier2 1 / 159
chr9:21974759 CCCCGGGCCGCGGCCGTGGCCAG C 1 / 3 p.L16fs c.46_67delCTGGCCACGGCCGCGGCCCGGG   Tier2 1 / 159
chr9:21974776 GGCCA G 1 / 3 p.L16fs c.47_50delTGGC COSV58683946 Tier2 1 / 159
chr9:21974782 C T 1 / 3 p.W15* c.45G>A COSV58683123 Tier2 1 / 159
chr9:21974787 C CT 1 / 3 p.D14fs c.39_40insA   Tier2 1 / 159
chr9:21974792 G T 1 / 3 p.S12* c.35C>A COSV58689693 Tier2 1 / 159
chr9:21974799 C A 1 / 3 p.E10* c.28G>T COSV58705987 Tier2 3 / 159
chr9:21970971 G T 2 / 3 p.Y129* c.387C>A COSV58684005 Tier2 2 / 159
chr9:21971000 C A 2 / 3 p.E120* c.358G>T COSV58683444 Tier2 3 / 159
chr9:21971005 GC G 2 / 3 p.A118fs c.352delG   Tier2 1 / 159
chr9:21971017 G A 2 / 3 p.P114L c.341C>T COSV58683051 Tier1 2 / 159
chr9:21971028 C T 2 / 3 p.W110* c.330G>A COSV58682827 Tier2 7 / 159
chr9:21971029 C T 2 / 3 p.W110* c.329G>A COSV58682976 Tier2 4 / 159
chr9:21971036 C G 2 / 3 p.D108H c.322G>C COSV58690035 Tier2 2 / 159
chr9:21971036 C A 2 / 3 p.D108Y c.322G>T COSV58682998 Tier2 1 / 159
chr9:21971057 C A 2 / 3 p.G101W c.301G>T COSV58692144 Tier1 1 / 159
chr9:21971068 A C 2 / 3 p.L97R c.290T>G COSV58684740 Tier1 1 / 159
chr9:21971069 G GCACC 2 / 3 p.L97fs c.285_288dupGGTG   Tier2 1 / 159
chr9:21971096 C A 2 / 3 p.E88* c.262G>T COSV58683071 Tier2 2 / 159
chr9:21971099 G A 2 / 3 p.R87W c.259C>T COSV58718452 Tier1 2 / 159
chr9:21971108 C A 2 / 3 p.D84Y c.250G>T COSV58683210 Tier1 1 / 159
chr9:21971108 C T 2 / 3 p.D84N c.250G>A COSV58683289 Tier2 1 / 159
chr9:21971110 T C 2 / 3 p.H83R c.248A>G COSV58689512 Tier2 2 / 159
chr9:21971111 G A 2 / 3 p.H83Y c.247C>T COSV58682852 Tier1 6 / 159
chr9:21971111 G C 2 / 3 p.H83D c.247C>G COSV58690009 Tier2 1 / 159
chr9:21971118 TC T 2 / 3 p.R80fs c.239delG COSV58729341 Tier2 1 / 159
chr9:21971120 G A 2 / 3 p.R80* c.238C>T COSV58682746 Tier2 16 / 159
chr9:21971123 TGA T 2 / 3 p.L78fs c.233_234delTC COSV58687173 Tier2 1 / 159
chr9:21971127 AGTGG A 2 / 3 p.A76fs c.227_230delCCAC   Tier2 1 / 159
chr9:21971138 C T 2 / 3 p.D74N c.220G>A COSV58688841 Tier1 2 / 159
chr9:21971139 GGC G 2 / 3 p.A73fs c.217_218delGC   Tier2 1 / 159
chr9:21971142 G T 2 / 3 p.C72* c.216C>A COSV58683179 Tier2 1 / 159
chr9:21971150 GC G 2 / 3 p.E69fs c.207delG   Tier2 1 / 159
chr9:21971150 GCT G 2 / 3 p.E69fs c.206_207delAG   Tier2 1 / 159
chr9:21971155 GC G 2 / 3 p.A68fs c.202delG   Tier2 1 / 159
chr9:21971174 GCTCCGCCACT G 2 / 3 p.V59fs c.174_183delAGTGGCGGAG   Tier2 1 / 159
chr9:21971177 C A 2 / 3 p.E61* c.181G>T COSV58683250 Tier2 4 / 159
chr9:21971179 GCCACT G 2 / 3 p.V59fs c.174_178delAGTGG COSV58693461 Tier2 1 / 159
chr9:21971186 G A 2 / 3 p.R58* c.172C>T COSV58682666 Tier2 14 / 159
chr9:21971197 A ATCAT 2 / 3 p.M54fs c.157_160dupATGA   Tier2 1 / 159
chr9:21971198 T TCA 2 / 3 p.M54fs c.158_159dupTG   Tier2 1 / 159