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CIC
基本情報
- 遺伝子名
-
capicua transcriptional repressor
- 慣用名
-
MRD45
- 遺伝子分類
-
がん遺伝子 / がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
-
腫瘍形成・増殖
- シグナル伝達経路
-
MAPK
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
19q13.2 (chr19:42788857..42799343)
- アミノ酸配列の長さ
-
1,608
遺伝子マップ
解説
CICはSIN3ヒストン脱アセチル化複合体と相互作用しヒストン脱アセチル化を介して転写を抑制する。CICは受容体チロシンキナーゼおよびMAPKのシグナルにより負に制御されているため、それら上流シグナルが活性化状態にある時はCICの活性は抑制され、CICの制御下の遺伝子は転写を行うことができる。CICの欠失や機能喪失型変異は、CICの上流シグナルの活性化状態と同様の下流分子に対する転写抑制作用が起きない状態を誘導する。CICの制御下にあり転写抑制を受けている遺伝子には、ETS転写因子であるETV1、ETV4、ETV5に加えてID1、CCND1、SHC3などが報告されている。乏突起膠腫においてCICの変異は高い頻度で認められる。
シグナル伝達経路
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
chr19:42791030 | C | T | 2 / 20 | p.Q59* | c.175C>T | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42791715 | C | T | 5 / 20 | p.R201W | c.601C>T | COSV50547633 | Tier2 | 2 / 116 |
chr19:42791757 | C | T | 5 / 20 | p.R215W | c.643C>T | COSV50547203 | Tier2 | 1 / 116 |
chr19:42791847 | G | T | 5 / 20 | p.E245* | c.733G>T | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42792016 | C | T | 6 / 20 | p.R274* | c.820C>T | COSV50631758 | Tier2 | 1 / 116 |
chr19:42793058 | CCGTTGCA | C | 7 / 20 | p.V318fs | c.951_957delCGTTGCA | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42793214 | ACAGT | A | 7 / 20 | p.S370fs | c.1110_1113delTCAG | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42793240 | C | T | 7 / 20 | p.Q378* | c.1132C>T | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42793462 | C | T | 8 / 20 | p.R422* | c.1264C>T | COSV104381975 | Tier2 | 1 / 116 |
chr19:42794881 | C | G | 10 / 20 | p.S654* | c.1961C>G | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42796320 | CCT | C | 12 / 20 | p.Q992fs | c.2973_2974delTC | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42796816 | A | AT | 14 / 20 | p.T1093fs | c.3275dupT | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42797278 | C | T | 15 / 20 | p.R1214* | c.3640C>T | COSV50569160 | Tier2 | 1 / 116 |
chr19:42797918 | GC | G | 16 / 20 | p.A1324fs | c.3971delC | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42798216 | C | A | 17 / 20 | p.Y1390* | c.4170C>A | Tier2 | 1 / 116 | |
chr19:42798833 | C | T | 19 / 20 | p.Q1469* | c.4405C>T | Tier2 | 1 / 116 |