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COL1A1

基本情報

遺伝子名
collagen type I alpha 1 chain
慣用名
CAFYD, EDSARTH1, EDSC, OI1, OI2, OI3, OI4
遺伝子分類
-
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
-
シグナル伝達経路
-
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
17q21.33 (chr17:48262863..48278874, complement)
アミノ酸配列の長さ
1,464

遺伝子マップ

解説

COL1A1は、2つのα1鎖および1つのα2鎖から成る三重らせんを有するI型コラーゲンのプロα1鎖をコードする。I型は大部分の結合組織に見られる原線維形成コラーゲンであり、骨、角膜、真皮および腱に豊富に存在する。この遺伝子のバリアントは、骨形成不全症I型?IV型、Ehlers-Danlos症候群ⅦA型、Ehlers-Danlos症候群古典型、Caffey病および特発性骨粗鬆症と関連している。この遺伝子と血小板由来成長因子βの遺伝子が位置する17番と22番染色体間の相互転座は、隆起性皮膚線維肉腫と呼ばれる特定の種類の皮膚腫瘍と関連しており、成長因子の発現が調節されないことに起因する。

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌