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GATA3
基本情報
- 遺伝子名
-
GATA binding protein 3
- 慣用名
-
HDR, HDRS
- 遺伝子分類
-
がん遺伝子 / がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
-
転写制御
- シグナル伝達経路
-
Transcriptional regulation
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
10p14 (chr10:8097619..8115986)
- アミノ酸配列の長さ
-
443
遺伝子マップ
解説
GATA3は、細胞および組織の発生・分化の調節に働くGATAファミリーに属する転写制御因子である。GATA3はヘルパーT細胞 (Th2細胞）の発生に関与するため、液性免疫およびアレルギー反応において重要である。また、乳腺上皮の発達に関与するため、その機能異常は乳癌の発生に影響を与えることが知られており、乳癌おいて体細胞変異の頻度が高い。生殖細胞系列変異は、副甲状腺機能低下症、感音難聴および腎疾患を特徴とするバラカット症候群との関連性が知られている。
遺伝子変異総量（Tumor Mutation Burden）の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
| 参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| chr10:8105964 | G | T | 4 / 6 | p.E262* | c.784G>T | Tier2 | 1 / 108 | |
| chr10:8106006 | C | T | 4 / 6 | p.R276* | c.826C>T | Tier2 | 1 / 108 | |
| chr10:8111475 | C | CA | 5 / 6 | p.T322fs | c.962dupA | COSV60515713 | Tier2 | 1 / 108 |
| chr10:8111495 | C | CTGGAGGA | 5 / 6 | p.R330fs | c.982_988dupTGGAGGA | COSV60516089 | Tier2 | 1 / 108 |
| chr10:8111534 | C | CT | 5 / 6 | p.C341fs | c.1021dupT | Tier2 | 1 / 108 | |
| chr10:8111543 | C | CT | 5 / 6 | p.Y344fs | c.1030dupT | COSV60515810 | Tier2 | 1 / 108 |
| chr10:8111555 | TC | T | 5 / 6 | p.H348fs | c.1042delC | Tier2 | 1 / 108 | |
| chr10:8115819 | AGCTCGTTTAACCCGGCC | A | 6 / 6 | p.S390fs | c.1168_1184delTCGTTTAACCCGGCCGC | Tier2 | 1 / 108 | |
| chr10:8115870 | ATC | A | 6 / 6 | p.S407fs | c.1219_1220delTC | COSV60516409 | Tier2 | 1 / 108 |
| chr10:8115873 | TC | T | 6 / 6 | p.S407fs | c.1220delC | COSV60516876 | Tier2 | 1 / 108 |
| chr10:8115874 | C | CA | 6 / 6 | p.P408fs | c.1220_1221insA | COSV60515158 | Tier2 | 1 / 108 |
| chr10:8115919 | TGCACCCGCCATCCA | T | 6 / 6 | p.H423fs | c.1268_1281delACCCGCCATCCAGC | Tier2 | 1 / 108 | |
| chr10:8115982 | G | GT | 6 / 6 | p.*444fs | c.1330dupT | COSV60520243 | Tier2 | 1 / 108 |