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KDM5A
基本情報
- 遺伝子名
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lysine demethylase 5A
- 慣用名
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RBBP-2, RBBP2, RBP2
- 遺伝子分類
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がん遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
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エピジェネティック制御
- シグナル伝達経路
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Epigenetic modification
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
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12p13.33 (chr12:394622..498257, complement)
- アミノ酸配列の長さ
-
1,690
遺伝子マップ
解説
KDM5Aは、メチル化されたヒストンH3のリジン4(H3K4)の脱メチル化に働くヒストン脱メチル化酵素であり、転写およびクロマチン構造の制御に関与する。乳癌をはじめとする様々ながん種においてamplificationとそれに伴う発現の亢進が認められている。KDM5Aにより抑制を受けている分子として、細胞分裂の抑制に働くCDK阻害分子p21やアポトーシスの誘導に関与するBAK1遺伝子が明らかになっている。
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
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