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LMO1

基本情報

遺伝子名
LIM domain only 1
慣用名
RBTN1, RHOM1, TTG1
遺伝子分類
がん遺伝子
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
転写制御
シグナル伝達経路
Transcriptional regulation
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
11p15.4 (chr11:8246163..8284909, complement)
アミノ酸配列の長さ
156

遺伝子マップ

解説

LMO1は、2つのシステインリッチLIMドメインを有するが,DNA結合ドメインを有さない転写制御因子である。LIMドメインは、タンパク質相互作用に影響を与え、特定のDNA結合転写因子に競合的に結合することにより転写を調節する。この遺伝子座の異常は、T細胞性急性リンパ芽球性白血病と関連している。この遺伝子座と少なくとも2つの遺伝子座(T細胞抗原受容体遺伝子のδサブユニットおよびLIMドメイン結合1遺伝子)との間に染色体再編成が認められる。

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌