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LMO1
基本情報
- 遺伝子名
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LIM domain only 1
- 慣用名
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RBTN1, RHOM1, TTG1
- 遺伝子分類
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がん遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
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転写制御
- シグナル伝達経路
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Transcriptional regulation
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
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11p15.4 (chr11:8246163..8284909, complement)
- アミノ酸配列の長さ
-
156
遺伝子マップ
解説
LMO1は、2つのシステインリッチLIMドメインを有するが,DNA結合ドメインを有さない転写制御因子である。LIMドメインは、タンパク質相互作用に影響を与え、特定のDNA結合転写因子に競合的に結合することにより転写を調節する。この遺伝子座の異常は、T細胞性急性リンパ芽球性白血病と関連している。この遺伝子座と少なくとも2つの遺伝子座(T細胞抗原受容体遺伝子のδサブユニットおよびLIMドメイン結合1遺伝子)との間に染色体再編成が認められる。
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌