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PTPRK
基本情報
- 遺伝子名
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protein tyrosine phosphatase receptor type K
- 慣用名
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R-PTP-kappa
- 遺伝子分類
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がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
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腫瘍形成・増殖
- シグナル伝達経路
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RTK
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
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6q22.33 (chr6:128291372..128841503, complement)
- アミノ酸配列の長さ
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1,439
遺伝子マップ
解説
PTPRKは、タンパク質チロシンホスファターゼ(PTP)ファミリーのメンバーである。PTPは、細胞増殖、分化、分裂周期および発がん性形質転換を含む様々な細胞プロセスを調節するシグナル伝達分子である。このPTPは、1つの細胞外領域、1つの単一膜貫通領域および2つのタンデム触媒ドメインを有する。この細胞外領域は、1つのメプリン-A5抗原-PTP mu (MAM)ドメイン、1つのIg様ドメインおよび4つのフィブロネクチンⅢ型様リピートを有する。このPTPは、接着結合でのβおよびγカテニンとの相互作用により、同種細胞間相互作用を介在する。
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
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- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌