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PTPRO
基本情報
- 遺伝子名
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protein tyrosine phosphatase receptor type O
- 慣用名
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GLEPP1, NPHS6, PTP-OC, PTP-U2, PTPROT, PTPU2, R-PTP-O
- 遺伝子分類
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- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
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腫瘍形成・増殖
- シグナル伝達経路
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RTK
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
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12p12.3, 12p13-p12 (chr12:15475661..15747975)
- アミノ酸配列の長さ
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1,216
遺伝子マップ

解説
PTPROは、受容体型タンパク質チロシンフォスファターゼのR3サブタイプファミリーで、極性細胞の頂端面に局在し、Srcファミリーキナーゼの活性化を介して組織特異的に機能する。この遺伝子は、2つの異なるプロモーターを含み、複数のアイソフォームをコードする選択的にスプライズされた転写物バリアントを生じる。また、破骨細胞の産生および活性の調節、細胞増殖の阻害ならびにアポトーシスを促進する。この遺伝子は、腫瘍抑制因子の候補でいくつかのがんにおいて、その発現低下が観察されている。
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布

- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
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