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RUNX1
基本情報
- 遺伝子名
-
RUNX family transcription factor 1
- 慣用名
-
AML1, AML1-EVI-1, AMLCR1, CBF2alpha, CBFA2, EVI-1, PEBP2aB, PEBP2alpha
- 遺伝子分類
-
がん遺伝子 / がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
-
転写制御
- シグナル伝達経路
-
Transcriptional regulation
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
21q22.12 (chr21:36164432..36259409, complement)
- アミノ酸配列の長さ
-
453
遺伝子マップ
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
chr21:36252877 | C | T | 2 / 6 | p.R135K | c.404G>A | COSV55868310 | Tier2 | 1 / 40 |
chr21:36231774 | G | A | 3 / 6 | p.R177* | c.529C>T | COSV55866185 | Tier2 | 1 / 40 |
chr21:36231775 | AG | A | 3 / 6 | p.P176fs | c.527delC | Tier2 | 1 / 40 | |
chr21:36231783 | G | A | 3 / 6 | p.R174* | c.520C>T | COSV55866784 | Tier1 | 1 / 40 |
chr21:36206717 | ACT | A | 4 / 6 | p.Q239fs | c.712_713delAG | COSV99038741 | Tier2 | 1 / 40 |
chr21:36171622 | CAG | C | 5 / 6 | p.S287fs | c.860_861delCT | COSV55866573 | Tier2 | 1 / 40 |
chr21:36171708 | T | TGGTA | 5 / 6 | p.Q259fs | c.772_775dupTACC | Tier2 | 1 / 40 | |
chr21:36171708 | T | TGGTAG | 5 / 6 | p.Q259fs | c.771_775dupCTACC | Tier2 | 1 / 40 |