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STK11
基本情報
- 遺伝子名
-
serine/threonine kinase 11
- 慣用名
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LKB1, PJS, hLKB1
- 遺伝子分類
-
がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
-
腫瘍形成・増殖
- シグナル伝達経路
-
PI3K/Akt/mTOR
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
19p13.3 (chr19:1206913..1226646)
- アミノ酸配列の長さ
-
433
遺伝子マップ
解説
STK11 (LKB1)はmTORI型複合体 (mTORC1)の活性を間接的に抑制するセリン/スレオニンキナーゼである。STK11は腫瘍内のエネルギー欠乏による代謝ストレスや低酸素状態に反応して活性化され、リン酸化により下流のAMPKを活性化する。続いてAMPKはRheb抑制因子TSC1/TSC2複合体のうちTSC2の活性化リン酸化部位である1227番目のチロシンおよび1345番目のセリンをリン酸化することでその抑制機能を活性化させRhebの活性低下を誘導し、mTORC1の活性を低下させる。機能失活型の体細胞変異は、肺腺癌において高い頻度で検出される。生殖細胞系列変異は、消化管に多発性の過誤腫性ポリープを生じさせるポイツ・ジェガーズ症候群との関連が報告されている。KRAS変異を有する非小細胞肺癌症例において、STK11の変異を同時に有する場合、免疫チェックポイント阻害剤の治療効果が低いことが報告されている。
シグナル伝達経路
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
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chr19:1206988 | ATCCACCGCATCGAC | A | 1 / 10 | p.I29fs | c.84_97delCATCGACTCCACCG | Tier2 | 1 / 51 | |
chr19:1207092 | C | G | 1 / 10 | p.Y60* | c.180C>G | COSV58821906 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1207162 | A | T | 1 / 10 | p.K84* | c.250A>T | COSV58820372 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1218422 | TC | T | 2 / 10 | p.Q100fs | c.298delC | COSV58830813 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1220375 | C | G | 4 / 10 | p.Y156* | c.468C>G | Tier2 | 1 / 51 | |
chr19:1220382 | C | T | 4 / 10 | p.Q159* | c.475C>T | COSV58820732 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1220408 | GC | G | 4 / 10 | p.H168fs | c.502delC | Tier2 | 1 / 51 | |
chr19:1220433 | G | A | 4 / 10 | p.D176N | c.526G>A | COSV58825680 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1220487 | G | T | 4 / 10 | p.D194Y | c.580G>T | COSV58820621 | Tier1 | 1 / 51 |
chr19:1220612 | C | A | 5 / 10 | p.C210* | c.630C>A | COSV58824243 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1221243 | G | T | 6 / 10 | p.E256* | c.766G>T | COSV58820855 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1221956 | G | T | 7 / 10 | p.E291* | c.871G>T | COSV58820471 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1223059 | G | A | 8 / 10 | p.W332* | c.996G>A | COSV58821923 | Tier2 | 1 / 51 |
chr19:1223132 | G | T | 8 / 10 | p.E357* | c.1069G>T | COSV100480973 | Tier2 | 1 / 51 |