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TSC1
基本情報
- 遺伝子名
-
TSC complex subunit 1
- 慣用名
-
TSC
- 遺伝子分類
-
がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
-
腫瘍形成・増殖
- シグナル伝達経路
-
PI3K/Akt/mTOR
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
9q34.13 (chr9:135771622..135804259, complement)
- アミノ酸配列の長さ
-
1,164
遺伝子マップ

解説
TSC1は、mTOR I型複合体 (mTORC1)の活性調節に働くがん抑制遺伝子である。mTORC1の活性化にはGTP結合型のRhebが必要である。TSC1はTSC2とヘテロ二量体を形成し、そのGTPase-activating protein(GAP)活性により、RHEBを不活性型のGDP結合型にすることで、mTORC1の活性を抑制する。上流のPI3Kの活性化は、AktによるTSC2のリン酸化引き起こすことで、GAP活性を阻害する。その結果GTP結合型のRhebが増え、mTORC1の活性化につながる。TSC1の生殖細胞系列変異は結節性硬化症との関連が知られている。体細胞変異は、様々ながん種で見られ、その大部分が機能喪失型変異である。
シグナル伝達経路
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布

- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
chr9:135801039 | G | A | 5 / 23 | p.Q100* | c.298C>T | Tier2 | 1 / 95 | |
chr9:135801105 | C | A | 5 / 23 | p.E78* | c.232G>T | COSV53765645 | Tier2 | 1 / 95 |
chr9:135798859 | GACA | G | 6 / 23 | p.V128del | c.381_383delTGT | COSV53767756 | Tier2 | 1 / 95 |
chr9:135797330 | A | G | 7 / 23 | p.L180P | c.539T>C | Tier2 | 1 / 95 | |
chr9:135796805 | G | A | 8 / 23 | p.R228* | c.682C>T | COSV53767064 | Tier2 | 2 / 95 |
chr9:135782182 | ATCACTTAGAGTGAC | A | 14 / 23 | p.V454fs | c.1360_1373delGTCACTCTAAGTGA | Tier2 | 1 / 95 | |
chr9:135781248 | G | A | 15 / 23 | p.Q573* | c.1717C>T | Tier2 | 1 / 95 | |
chr9:135781386 | G | A | 15 / 23 | p.Q527* | c.1579C>T | COSV53763886 | Tier2 | 1 / 95 |
chr9:135781440 | G | A | 15 / 23 | p.R509* | c.1525C>T | COSV53764587 | Tier2 | 1 / 95 |
chr9:135781448 | GGA | G | 15 / 23 | p.P506fs | c.1515_1516delTC | Tier2 | 1 / 95 | |
chr9:135778009 | G | A | 18 / 23 | p.Q792* | c.2374C>T | Tier2 | 1 / 95 | |
chr9:135772964 | C | A | 21 / 23 | p.E887* | c.2659G>T | Tier2 | 1 / 95 | |
chr9:135772018 | T | TC | 23 / 23 | p.G1034fs | c.3098dupG | Tier2 | 1 / 95 |