Side Menu

VHL

基本情報

遺伝子名
von Hippel-Lindau tumor suppressor
慣用名
HRCA1, RCA1, VHL1, pVHL
遺伝子分類
がん抑制遺伝子
遺伝子ID
転写産物ID
機能分類
腫瘍形成・増殖
シグナル伝達経路
PI3K/Akt/mTOR
染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
3p25.3 (chr3:10183532..10191649)
アミノ酸配列の長さ
213

遺伝子マップ

解説

VHL (pVHL) はE3ユビキチンリガーゼであり、通常酸素条件下において転写制御因子HIF1αに結合しユビキチン化することで、プロテアソームによる分解誘導を介したHIF1αの活性調節に関与する。pVHLの生殖細胞系列変異は、優性遺伝性の家族性がん症候群であるVon Hippel-Lindau症候群の原因であり、その変異の多くがHIF1αとの結合領域における変化である。pVHLの機能低下はHIF1αの恒常的活性化を誘導するため、その制御下にある血管新生に関与するVEGFやグルコースの取り込みに関与するGLUT1の発現誘導が起こり、細胞増殖の亢進が引き起こされる。体細胞変異は淡明細胞型腎細胞癌において高い頻度で認められる。

シグナル伝達経路

がん種別変異頻度Tumor type

遺伝子変異

コピー数変化

遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB

アミノ酸配列上の変異分布



  • 低悪性度
    神経膠腫
  • 多形膠芽腫
  • 髄膜腫
  • 頭頸部
    扁平上皮癌
  • 唾液腺癌
  • 食道扁平上皮癌
  • 胃腺癌
  • 小腸癌
  • 結腸腺癌
  • 直腸腺癌
  • 肝細胞癌
  • 胆管癌
  • 膵腺癌
  • 肺腺癌
  • 肺扁平上皮癌

  • 神経内分泌腫瘍
  • 胸膜中皮腫
  • 胸腺腫
  • 浸潤性乳管癌
  • 浸潤性小葉癌
  • 化生癌
  • 骨肉腫
  • 消化管間質腫瘍
  • 軟部肉腫
  • 子宮頸癌
  • 子宮類内膜腺癌
  • 上皮性卵巣癌
  • 淡明細胞型
    腎細胞癌
  • 悪性黒色腫
  • 有棘細胞癌

ドライバー変異リスト

参照配列上の
位置
(GRCh37/hg19)
参照配列の塩基 変異の塩基 変異が位置するエクソン番号 変異
(アミノ酸
変化)
変異
(CDS
変化)
COSMIC登録ID (v92) がん化との
関連度による
分類
変異が検出されたサンプル数
chr3:10183706 CCG C 1 / 3 p.R60fs c.178_179delCG COSV56565369 Tier2 1 / 34
chr3:10183785 T C 1 / 3 p.L85P c.254T>C COSV56542730 Tier2 1 / 34
chr3:10183791 TATGGCTCAACTTCG T 1 / 3 p.W88fs c.262_275delTGGCTCAACTTCGA   Tier2 1 / 34
chr3:10183817 C T 1 / 3 p.Q96* c.286C>T COSV56546894 Tier2 1 / 34
chr3:10183853 CG C 1 / 3 p.R108fs c.323delG   Tier2 1 / 34
chr3:10188208 G C 2 / 3 p.W117C c.351G>C COSV56550455 Tier2 1 / 34
chr3:10188300 TTGCCAATATCACAC T 2 / 3 p.N150fs c.449_462delATATCACACTGCCA   Tier2 1 / 34
chr3:10188303 CCAATATCA C 2 / 3 p.N150fs c.449_456delATATCACA   Tier2 1 / 34
chr3:10191479 C G 3 / 3 p.L158V c.472C>G COSV56544074 Tier2 2 / 34
chr3:10191524 G T 3 / 3 p.E173* c.517G>T COSV56551494 Tier2 1 / 34