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VHL
基本情報
- 遺伝子名
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von Hippel-Lindau tumor suppressor
- 慣用名
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HRCA1, RCA1, VHL1, pVHL
- 遺伝子分類
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がん抑制遺伝子
- 遺伝子ID
- 転写産物ID
- 機能分類
-
腫瘍形成・増殖
- シグナル伝達経路
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PI3K/Akt/mTOR
- 染色体上の位置 (GRCh37/hg19)
-
3p25.3 (chr3:10183532..10191649)
- アミノ酸配列の長さ
-
213
遺伝子マップ
解説
VHL (pVHL) はE3ユビキチンリガーゼであり、通常酸素条件下において転写制御因子HIF1αに結合しユビキチン化することで、プロテアソームによる分解誘導を介したHIF1αの活性調節に関与する。pVHLの生殖細胞系列変異は、優性遺伝性の家族性がん症候群であるVon Hippel-Lindau症候群の原因であり、その変異の多くがHIF1αとの結合領域における変化である。pVHLの機能低下はHIF1αの恒常的活性化を誘導するため、その制御下にある血管新生に関与するVEGFやグルコースの取り込みに関与するGLUT1の発現誘導が起こり、細胞増殖の亢進が引き起こされる。体細胞変異は淡明細胞型腎細胞癌において高い頻度で認められる。
シグナル伝達経路
遺伝子変異総量(Tumor Mutation Burden)の分布TMB
アミノ酸配列上の変異分布
- 低悪性度
神経膠腫 - 多形膠芽腫
- 髄膜腫
- 頭頸部
扁平上皮癌 - 唾液腺癌
- 食道扁平上皮癌
- 胃腺癌
- 小腸癌
- 結腸腺癌
- 直腸腺癌
- 肝細胞癌
- 胆管癌
- 膵腺癌
- 肺腺癌
- 肺扁平上皮癌
- 肺
神経内分泌腫瘍 - 胸膜中皮腫
- 胸腺腫
- 浸潤性乳管癌
- 浸潤性小葉癌
- 化生癌
- 骨肉腫
- 消化管間質腫瘍
- 軟部肉腫
- 子宮頸癌
- 子宮類内膜腺癌
- 上皮性卵巣癌
- 淡明細胞型
腎細胞癌 - 悪性黒色腫
- 有棘細胞癌
ドライバー変異リスト
参照配列上の 位置 (GRCh37/hg19) |
参照配列の塩基 | 変異の塩基 | 変異が位置するエクソン番号 | 変異 (アミノ酸 変化) |
変異 (CDS 変化) |
COSMIC登録ID (v92) | がん化との 関連度による 分類 |
変異が検出されたサンプル数 |
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chr3:10183706 | CCG | C | 1 / 3 | p.R60fs | c.178_179delCG | COSV56565369 | Tier2 | 1 / 34 |
chr3:10183785 | T | C | 1 / 3 | p.L85P | c.254T>C | COSV56542730 | Tier2 | 1 / 34 |
chr3:10183791 | TATGGCTCAACTTCG | T | 1 / 3 | p.W88fs | c.262_275delTGGCTCAACTTCGA | Tier2 | 1 / 34 | |
chr3:10183817 | C | T | 1 / 3 | p.Q96* | c.286C>T | COSV56546894 | Tier2 | 1 / 34 |
chr3:10183853 | CG | C | 1 / 3 | p.R108fs | c.323delG | Tier2 | 1 / 34 | |
chr3:10188208 | G | C | 2 / 3 | p.W117C | c.351G>C | COSV56550455 | Tier2 | 1 / 34 |
chr3:10188300 | TTGCCAATATCACAC | T | 2 / 3 | p.N150fs | c.449_462delATATCACACTGCCA | Tier2 | 1 / 34 | |
chr3:10188303 | CCAATATCA | C | 2 / 3 | p.N150fs | c.449_456delATATCACA | Tier2 | 1 / 34 | |
chr3:10191479 | C | G | 3 / 3 | p.L158V | c.472C>G | COSV56544074 | Tier2 | 2 / 34 |
chr3:10191524 | G | T | 3 / 3 | p.E173* | c.517G>T | COSV56551494 | Tier2 | 1 / 34 |